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内分泌科
内分泌科成立于2008年，市级临床医学重点科室、黄山市内分泌代谢性疾病质控中心、国家标准化代谢性疾病管理中心（MMC）、安徽省糖尿病专科护士临床实践培训基地、“安徽省糖尿病防治专科联盟”常务理事单位、“安徽省1型糖尿病专病联盟”理事单位、“安徽省骨质疏松症防治联盟”理事单位；现有医务人员21人，其中主任医师1人，副主任医师3人，糖尿病专科护士8人。
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神经内科
黄山市人民医院神经内科组建于1996年，是安徽省临床重点特色专科、黄山市临床重点专科、国家级住院医师规范化培训基地、国家级高级卒中中心建设单位。
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肾内科
肾内科创建于1996年2月，是黄山市唯一的肾脏病专科，承担着黄山市及周边地区肾脏病的诊治工作。2010年附设腹膜透析中心，2014年被评为市级重点学科。2015年开设了结肠透析治疗和双肾激光治疗，2016年又开设尿旁CRRT治疗。
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妇产科
我院妇产科始建于1938年，历经80余年的发展，2017年11月妇产科分为妇科和产科2个亚专科。
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血液风湿免疫科
血液风湿免疫科成立于上世纪70年代，其中血液专科是当时省内医院最早设立的血液专科之一，目前诊治水平在省内同级医院中处于领先地位，是安徽省白血病、淋巴瘤及浆细胞疾病专科联盟理事单位，安徽省血液病专科医疗联合体成员单位、安徽省罕见血液病联盟成员单位、安徽省血液肿瘤精准诊断与治疗专科联盟理事单位、黄山市临床重点学科，上海仁济风湿专科联盟成员单位。
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